部分基层组织功能发挥有所弱化，必须重视从制度上建强支部，确保党支部政治领导的有力实施。历史经验表明，制度保证是充分发挥“支部建在连上”政治优势的根本举措。“水口连队建党”的实践，开启了探索军队基层党组织制度建设的先河，由此才有了我们党对军队政治领导、思想领导、组织领导等一系列原则制度的确立、发展和完善，确保了党指挥枪真正落到实处。在新的历史条件下，确保党对军队绝对领导，就要一以贯之地坚持好党指挥枪一系列原则制度，充分发挥制度的保证作用。当前，部分党支部组织功能弱化主要弱在制度落实不够，影响了党支部政治领导的实施。必须着眼不同类型基层的特点，在坚持制度、务求实效上下功夫。要增强党性锻炼的自觉性，党支部要站在把党对军队绝对领导落实到基层的高度，认真落实各项组织生活制度，党员要站在听党话、守纪律的高度，积极参加党内生活，自觉接受党的教育，经受党性考验。要增强党内教育的针对性，针对支部内党员思想实际，扎实开展党支部整顿，严肃进行党性分析，使党员每参加一次组织生活，思想觉悟就得到一次提高。要增强组织生活的时效性，针对基层工作任务繁重的实际，倡导开短会、讲短话、上短课。同时大胆创新，用社会资源进行教育，用特色文化进行熏陶，用现代传媒进行引导，确保组织生活落到实处。
新时期部队使命任务不断拓展，必须重视从能力上建强支部，确保主题和主线在基层有力推进、有效落实。围绕中心抓党建，抓好党建促中心，是“支部建在连上”必须始终遵循的重要原则。从历史实践看，在人民解放军发展壮大的每个阶段，我们的基层党建工作都注重围绕当时所担负的任务来展开，有效提高了履行使命的能力。土地革命战争时期，依靠党支部团结官兵，较好地完成了打仗、筹款、做群众工作等艰巨任务。抗日战争时期，各个党支部带领连队进行军事、政治训练，开展整风和大生产运动，达到了中央军委提出的“一面战斗，一面生产，一面学习”的要求。解放战争中，各党支部领导连队开展杀敌立功运动，团结互助运动，发扬三大民主，进行新式整军，有力地推动了“打倒蒋介石，解放全中国”这一历史性胜利。新中国成立后，连队党支部紧紧围绕提升军事能力开展活动，战斗堡垒作用发挥得更加充分。当前，胡锦涛主席和中央军委提出的以推动国防和军队建设科学发展为主题、以加快转变战斗力生成模式为主线的战略思想，给基层建设赋予了新的时代内涵。党支部作为最直接从思想上政治上组织上掌握部队的战斗堡垒，必须担负起唱好主角、抓好落实的重要职责，为围绕主题主线抓建基层提供坚强组织保证。要强化准备打仗意识，不断抓好使命任务教育，不断打牢聚焦主题和主线的思想基础。要推进人才建设向信息化转型，组织好信息化基础知识和基本信息技能的学习培训，为推进主题和主线落实提供人才支撑。要兴起大抓军事训练热潮，把创先争优活动引向训练场演习场，为推进主题和主线落实提供有力抓手。要把支部班子岗位练兵向基于信息系统体系作战能力聚焦，坚持把练兵重点转到信息化学习、钻研和运用上，着力提高党支部推进主题和主线落实的能力。
当前部分国防后备力量基层党组织结构不健全，必须重视预备役民兵党支部建设，确保枪杆子牢牢掌握在党的手中。“支部建在连上”是把“党对军队绝对领导”原则贯彻到基层、“达于士兵”的最佳组织形式，是巩固党的执政地位、增强执政力量的组织根基。预备役民兵是我国武装力量的重要组成部分，如何通过有效的基层党建工作，把他们凝聚和团结起来，做到任何时候、任何情况下都坚决听从党中央、中央军委和胡锦涛主席的指挥，这本身就是在做巩固基层政权的工作。当前，预备役民兵基层党组织建设还存在一些薄弱环节，比如预备役连队党支部编配结构不合理，支部书记由预任军官担任，大部分时间在编不在岗，职能履行不够好；民兵营、连普遍没有建立党的基层组织，党员队伍均零散编靠在原行政单位党组织开展活动，每年的民兵整组只进行行政编组，党组织整编一直是个盲区。因此，健全预备役民兵基层党组织，把支部建在民兵连上，发挥预备役民兵党组织的“三个作用”，有着很强的现实意义。要坚持依法组建，深入学习贯彻新颁发的《中国人民解放军预备役部队政治工作规定》和《民兵政治工作规定》，着眼有利于落实党管武装制度，有利于组织开展工作，有利于加强自身建设，修改完善有关预备役民兵党组织建设的政策规定。要坚持科学抓建，深入推进建设学习型党组织和创先争优活动，进一步建强党员队伍，发挥组织功能，把预备役民兵党支部的作用更好地体现出来，使基层政权坚如磐石。
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